Estudio genómico comparativo de las cepas de Ralstonia solanacearum causantes de la marchitez bacteriana de la papa en Uruguay

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Título

Estudio genómico comparativo de las cepas de Ralstonia solanacearum causantes de la marchitez bacteriana de la papa en Uruguay

Tema

MICROBIOLOGÍA
FITOPATOLOGÍA
RALSTONIA SOLANACEARUN
TESIS
TESIS DE DOCTORADO
URUGUAY

Abstract

Estudio genómico comparativo de las cepas de Ralstonia solanacearum causantes de la marchitez bacteriana de la papa en Uruguay Ralstonia solanacearum es el agente responsable de la marchitez bacteriana, una de las enfermedades de plantas más destructivas a nivel mundial. En Uruguay este patógeno constituye uno de los principales problemas sanitarios asociados al cultivo de papa. El objetivo general de esta tesis es generar conocimiento sobre las cepas de R. solanacearum que afectan los cultivos de papa en Uruguay, de forma de contribuir al desarrollo de estrategias efectivas para su control. Para ello, se generó una colección de cepas uruguayas de R. solanacearum encontrando que todas pertenecen al filotipo IIB, secuevar 1 (IIB-1), un grupo especialmente adaptado a la papa como hospedero y que se asocia a climas templados. Se encontraron diferencias de agresividad entre las cepas sobre varios hospederos incluyendo tomate, papa y la especie silvestre Solanum commersonii, una especie silvestre nativa de Uruguay considerada una valiosa fuente de resistencia en programas de mejoramiento de papa. La diversidad genética se evaluó mediante marcadores BOX-PCR y por hibridación genómica comparativa (CGH) usando la tecnología de microarrays. Globalmente estos análisis revelaron una baja diversidad genética entre las cepas presentes en Uruguay y confirmaron su clasificación como filotipo IIB, secuevar 1. El análisis genómico comparativo por CGH permitió establecer el contenido genético de cada una de las cepas uruguayas analizadas. Esta información se analizó con dos enfoques diferentes. Por un lado, se comparó el contenido genético entre cepas con diferente nivel de agresividad u origen de aislamiento, identificando genes involucrados en la virulencia de R. solanacearum. Por otro lado, los datos generados se utilizaron para establecer una lista de genes específicos de cepas IIB-1, los cuales se aplicaron al desarrollo de métodos de detección específicos que permitan evitar la diseminación del patógeno. Los resultados generados en esta tesis contribuyen a aumentar el valor biológico de los datos de secuencia actualmente disponibles y apuntan a su aprovechamiento para el desarrollo de estrategias de control de este importante patógeno.

Autor

Siri, María Inés

Editor

Facultad de Química
UdelaR

Fecha

2010

Colaborador

 Pianzzola,María Julia (Directora de Tesis)

 Boucher,Christian (Director de Tesis)

Derechos

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Formato

Papel
Pdf

Extent

181 p.

Idioma

Español

Tipo

Tesis

Identificador

TD 576.8 SIR.

Cobertura

Uruguay
Fecha de agregación
August 10, 2012
Colección
Tesis de doctorado, maestría, trabajos de diploma y monografías técnicas
Tipo de Elemento
Document
Etiquetas
Citación
Siri, María Inés, “Estudio genómico comparativo de las cepas de Ralstonia solanacearum causantes de la marchitez bacteriana de la papa en Uruguay,” RIQUIM - Repositorio Institucional de la Facultad de Química - UdelaR, accessed December 8, 2019, http://riquim.fq.edu.uy/items/show/55.
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