Identification of Zika Virus NS2B-NS3 Protease Inhibitors by Structure-Based Virtual Screening and Drug Repurposing Approaches

Dublin Core

Título

Identification of Zika Virus NS2B-NS3 Protease Inhibitors by Structure-Based Virtual Screening and Drug Repurposing Approaches

Tema

ENZIMAS
VIRUS ZIKA
TECNOLOGIA VIRTUAL
BIBLIOGRAFIA NACIONAL QUIMICA
2020

Abstract

The NS2B-NS3 protease has been identified as an attractive target for drug development against Zika virus (ZIKV) and combined drug repurposing and structure-based virtual screening has improved the development of antiviral drugs. In this study, we performed a structure-based virtual screening of 1861 Food and Administration (FDA) approved drugs available in DrugBank by the selection and docking validation of crystal structure of ZIKV NS2B-NS3 protease (PDB ID 5H4I) using Glide and DOCK 6 software. The antihistaminic chlorcyclizine (Grid score −24.8 kcal/mol) exhibited the most promising interaction with NS2B-NS3 protease in comparison to crystallography ligand (Grid score −15.6 kcal/mol) by interaction to Tyr161 by hydrophobic interactions in the binding site of NS2B-NS3 which is recognized as an important amino acid in substrate molecular recognition. Cytotoxicity and global antiviral activity assay in Vero cells by MTT method showed that chlorcyclizine reduced the ZIKV induced cytopathic effect (EC50 of 69.0 ± 7.3 μM and SI = 1.9), and explicit molecular dynamics simulations implemented on a NAMD program indicated great stability of chlorcyclizine in protease binding site, suggesting the repurposing of chlorcyclizine as a promising finding in anti-ZIKV drug development.

Autor

Santos, Felipe
Nunes, Damiana Antônia de Fátima
Lima, William Gustavo
Davyt, Danilo
Lara Santos, Luciana
Gutteres Taranto, Alex
Siqueira Ferreira Jaqueline Maria

Fuente

Journal of Chemical Information and Modeling. v. 60, 2020. -- p.731-737

Editor

American Chemical Society

Fecha

2020

Derechos

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Formato

PDF

Idioma

Inglés

Tipo

Artículo

Identificador

https://doi.org/10.1021/acs.jcim.9b00933

Document Item Type Metadata

Original Format

PDF
Fecha de agregación
May 12, 2020
Colección
Bibliografía Nacional Química
Tipo de Elemento
Document
Etiquetas
, , ,
Citación
Santos, Felipe, “Identification of Zika Virus NS2B-NS3 Protease Inhibitors by Structure-Based Virtual Screening and Drug Repurposing Approaches,” RIQUIM - Repositorio Institucional de la Facultad de Química - UdelaR, accessed April 18, 2021, http://riquim.fq.edu.uy/items/show/6058.
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