Adjustments, extinction, and remains of selenocysteine incorporation machinery in the nematode lineage

Dublin Core

Título

Adjustments, extinction, and remains of selenocysteine incorporation machinery in the nematode lineage

Tema

QUIMICA INORGANICA
SELENOCISTEINA
BIBLIOGRAFIA NACIONAL QUIMICA
2014

Abstract

Selenocysteine (Sec) is encoded by an UGA codon with the help of a SECIS element present in selenoprotein mRNAs. SECIS-binding protein (SBP2/SCBP-2) mediates Sec insertion, but the roles of its domains and the impact of its deficiency on Sec insertion are not fully understood. We used Caenorhabditis elegans to examine SBP2 function since it possesses a single selenoprotein, thioredoxin reductase-1 (TRXR-1). All SBP2 described so far have an RNA-binding domain (RBD) and a Sec-incorporation domain (SID). Surprisingly, C. elegans SBP2 lacks SID and consists only of an RBD. An sbp2 deletion mutant strain ablated Sec incorporation demonstrating SBP2 essentiality for Sec incorporation. Further in silico analyses of nematode genomes revealed conservation of SBP2 lacking SID and maintenance of Sec incorporation linked to TRXR-1. Remarkably, parasitic plant nematodes lost the ability to incorporate Sec, but retained SecP43, a gene associated with Sec incorporation. Interestingly, both selenophosphate synthetase (SPS) genes are absent in plant parasitic nematodes, while only Cys-containing SPS2 is present in Sec-incorporating nematodes. Our results indicate that C. elegans and the nematode lineage provide key insights into Sec incorporation and the evolution of Sec utilization trait, selenoproteomes, selenoproteins, and Sec residues. Finally, our study provides evidence of noncanonical translation initiation in C. elegans, not previously known for this well-established animal model.

Autor

Romanelli Cedrez, Laura.
Turanov, Anton A.
Gladyshev, Vadim N.
Miranda-Vizuete, Antonio

Fuente

RNA v. 20, no. 7, 2014. -- p. 1023-1034

Editor

Cold Spring Harbor Laboratory Press

Fecha

2014

Derechos

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Formato

PDF

Idioma

Inglés

Tipo

Artículo

Identificador

doi: 10.1261/rna.043877.113

Document Item Type Metadata

Original Format

PDF
Fecha de agregación
December 11, 2014
Colección
Bibliografía Nacional Química
Tipo de Elemento
Document
Etiquetas
,
Citación
Otero, Lucía, “Adjustments, extinction, and remains of selenocysteine incorporation machinery in the nematode lineage,” RIQUIM - Repositorio Institucional de la Facultad de Química - UdelaR, accessed December 14, 2019, http://riquim.fq.edu.uy/items/show/2259.
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