Assessment of HV1 and HV2 mtDNA variation for forensic purposes in an Uruguayan population sample.

Dublin Core

Título

Assessment of HV1 and HV2 mtDNA variation for forensic purposes in an Uruguayan population sample.

Tema

URUGUAY
POBLACION
ESTUDIOS FORENSES
BIBLIOGRAFIA NACIONAL QUIMICA
2005

Abstract

In order to assess the utility of mtDNA typing for forensic purposes in Uruguay, a population sample of 120 maternally unrelated individuals were amplified and directly sequenced for the HV1 and for the HV2 segments in the control region of the human mtDNA, following previous international recommendations (1). Blood and saliva samples were taken from 120 unrelated individuals and deposited into FTA cards (FTA card, Whatman WB 12-0205). The DNA was extracted in a 1.2 mm punch according to the manufacturer recommendations. DNA amplification and sequencing was performed according to previously published paper (2). All statistical analysis were calculated using the Arlequin Software ver. 2.000 (3). Results are shown in Table 1. In this population sample, 107 different mtDNA sequences were observed out of 120 individuals. Of these, 97 sequences were observed once (80.8%), 8 sequences were observed twice (13.3%), one sequence was observed three times (2.5%), and another four times (3.3%). The variation of mtDNA HV1 and HV2 regions was confined to 146 positions, of which 99 was observed in the HV1 and 47 in the HV2. Sequence variation consisted of 120 transitions, 21 transversions, and 11 indels. The genetic diversity value for combined HV1 and HV2 regions was 0.998 (±0.002) in this Uruguayan population sample, and the nucleotide diversity was 0.068 (±0.035). The complete dataset is available to any interested researcher at: http://www.lorgen.com/forense

Autor

Pagano, Sinthia
Sans, Mónica
Pimenoff, Ville
Cantera, Ana María
Alvarez, J. Carlos
Lorente, José A
Mones, Pablo
Sajantila, Antti

Fuente

Journal of Forensic Sciences v. 50, no. 5, 2005. -- p. 1239-1242

Editor

ASTM

Fecha

2005

Derechos

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Formato

PDF

Idioma

Inglés

Tipo

Artículo

Identificador

ID JFS2004362

Cobertura

Uruguay

Document Item Type Metadata

Original Format

PDF
Fecha de agregación
March 26, 2015
Colección
Bibliografía Nacional Química
Tipo de Elemento
Document
Etiquetas
, ,
Citación
Pagano, Sinthia, “Assessment of HV1 and HV2 mtDNA variation for forensic purposes in an Uruguayan population sample.,” RIQUIM - Repositorio Institucional de la Facultad de Química - UdelaR, accessed August 22, 2019, http://riquim.fq.edu.uy/items/show/2614.
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