Dynga : a general purpose QM-MM-MD program. I. Application to water

Dublin Core

Título

Dynga : a general purpose QM-MM-MD program. I. Application to water

Tema

AGUAS
QUIMICA CUANTICA
BIBLIOGRAFIA NACIONAL QUIMICA

Abstract

We present a general purpose QM-MM-MD engine (DYNGA) designed to test alternative hybrid Hamiltonians geared towards the treatment of problems of interest in structural biology including the use of experimental data constraints. In this first presentation we use DYNGA to explore the behaviour of a traditional QM-MM approach in the treatment of the water–water interaction. We find the potential energy hypersurface for the water dimer computed with the HF 4-31G*/TIP3P hybrid Hamiltonian tends to be too flat. We also explore the effect of using traditional QM-MM techniques on proton wires and conclude there is a need for improvement, possibly addressed by using polarizable force fields.

Autor

Parker, C. L.
Ventura, O. N.
Burt, S. K.
Cachau, R. E.

Fuente

Molecular Physics v. 101, no. 17, 2003. -- p. 2659-2668

Editor

Taylor & Francis Ltd

Fecha

2003

Derechos

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Formato

PDF

Idioma

Inglés

Tipo

Artículo

Identificador

DOI: 10.1080/0026897031000137698
Fecha de agregación
April 13, 2015
Colección
Bibliografía Nacional Química
Tipo de Elemento
Document
Etiquetas
,
Citación
Parker, C. L., “Dynga : a general purpose QM-MM-MD program. I. Application to water,” RIQUIM - Repositorio Institucional de la Facultad de Química - UdelaR, accessed December 2, 2020, http://riquim.fq.edu.uy/items/show/2716.
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