The effect of expression levels on codon usage in plasmodium falciparum.

Dublin Core

Título

The effect of expression levels on codon usage in plasmodium falciparum.

Tema

ESCHERICCHIA COLI
PLASMODIUM FALCIPARUM
BIBLIOGRAFIA NACIONAL QUIMICA
2004

Abstract

The usage of alternative synonymous codons in the completely sequenced, extremely A+T-rich parasite Plasmodium falciparum was studied. Confirming previous studies obtained with less than 3% of the total genes recently described, we found that A- and U-ending triplets predominate but translational selection increases the frequency of a subset of codons in highly expressed genes. However, some new results come from the analysis of the complete sequence. First, there is more variation in GC3 than previously described; second, the effect of natural selection acting at the level of translation has been analysed with real expression data at 4 different stages and third, we found that highly expressed proteins increment the frequency of energetically less expensive amino acids. The implications of these results are discussed.

Autor

Peixoto, L
Fernández, Verónica

Musto, H

Fuente

Parasitology v. 128, 2004. -- p. 245-251

Editor

Cambridge University

Fecha

2004

Derechos

Información sobre Derechos de Autor

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Formato

PDF

Idioma

Inglés

Tipo

Artículo

Identificador

DOI: http://dx.doi.org/10.1017/S0031182003004517

Document Item Type Metadata

Original Format

PDF
Fecha de agregación
April 21, 2015
Colección
Bibliografía Nacional Química
Tipo de Elemento
Document
Etiquetas
,
Citación
Peixoto, L, “The effect of expression levels on codon usage in plasmodium falciparum.,” RIQUIM - Repositorio Institucional de la Facultad de Química - UdelaR, accessed April 23, 2024, https://riquim.fq.edu.uy/items/show/2840.
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