A molecular dynamic study of the structure of glutathione reductase.

Dublin Core

Título

A molecular dynamic study of the structure of glutathione reductase.

Tema

GLUTATIONA REDUCTASA
ESTUDIO MOLECULAR
ENZIMAS
BIBLIOGRAFIA NACIONAL QUIMICA
1995

Abstract

A 200 ps molecular dynamics trajectory for the 8634 atoms corresponding to the enzyme glutathione reductase were calculated with the GROMOS program. This enzyme is formed by two identical subunits, with 478 residues and a flavinadenine dinucleotide (FAD) molecule each. Four regions are well distinguished in its crystallographic structure, the dimer interface, the FAD binding site, the active site and the crystal contact region. The analysis shows an equilibrated trajectory after 40 ps. The r.m.s. difference between the X-ray structure and the conformation along the simulation is 2.4 Å when considering the r.m.s. of the whole molecule. The structure is locally well conserved. Values of r.m.s. lower than 2.0 Å are found for all regions, with the exception of the crystal contact region. The results give evidence of a fairly stable fold, especially for the catalytically active regions even in the absence of explicit solvent collisions.

Autor

Hikichi, N
Hansz, M
Tapia, O

Fuente

Journal of Molecular Structure: THEOCHEM v. 335, 1995. -- p. 243-254

Editor

Elsevier

Fecha

1995

Derechos

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Formato

PDF

Idioma

Inglés

Tipo

Artículo

Identificador

doi:10.1016/0166-1280(94)04005-D

Document Item Type Metadata

Original Format

PDF
Fecha de agregación
December 8, 2015
Colección
Bibliografía Nacional Química
Tipo de Elemento
Document
Etiquetas
, ,
Citación
Hikichi, N, “A molecular dynamic study of the structure of glutathione reductase.,” RIQUIM - Repositorio Institucional de la Facultad de Química - UdelaR, accessed August 12, 2020, http://riquim.fq.edu.uy/items/show/3597.
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