Molecular modelling of glutatione : a comparison with crystallographic data

GLUTATIONA

MODELO MOLECULAR

CRISTALOGRAFIA

BIBLIOGRAFIA NACIONAL QUIMICA

1990

Glutathione (GSH) is formed in the enzymatic reaction of oxidized glutathione (GSSG) by glutathione reductase (GR). The knowledge of the structures of GSSG and GSH is the first step in planning a design of a drug which reacts with the enzyme. GSH is a polypeptide, the crystallographic structure of which is known, but this is not the case for GSSG and other drugs. Considering this situation, our goal was to validate a force-field method that permits the rapid determination of a structure similar to the actual one. We used the MM2 molecular-mechanics method including some absent parameters determined m this work from MNDO semiempirical calculations (all the bending and torsional constants for reproducing the R-CO-NH-R' structures ). We then added these parameters to the force-field program and obtained an optimized structure for GSH which is compared with the crystallographic data. The root-mean-square (r.m.s.) difference between the crystallographic planar angles and the optimized ones is 0.8°, while for dihedral angles it is 4.5 °. The force field generated is suitable for reproducing the crystallographic structure with high precision in terms of the bond angles. The opposite is true with respect to torsional angle

Journal of Molecular Structure: THEOCHEM v. 69, , 1990. -- p. 467

Elsevier

1990

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Artículo

DOI:10.1016/0166-1280(90)80070-5

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