Selenoprotein gene nomenclature

Dublin Core

Título

Selenoprotein gene nomenclature

Tema

PROTEINAS
GENES
SELENOPROTEINAS
BIBLIOGRAFIA NACIONAL QUIMICA
2016

Abstract

The human genome contains 25 genes coding for selenocysteine-containing proteins (selenoproteins). These proteins are involved in a variety of functions, most notably redox homeostasis. Selenoprotein enzymes with known functions are designated according to these functions: TXNRD1, TXNRD2, and TXNRD3 (thioredoxin reductases), GPX1, GPX2, GPX3, GPX4, and GPX6 (glutathione peroxidases), DIO1, DIO2, and DIO3 (iodothyronine deiodinases), MSRB1 (methionine sulfoxide reductase B1), and SEPHS2 (selenophosphate synthetase 2). Selenoproteins without known functions have traditionally been denoted by SEL or SEP symbols. However, these symbols are sometimes ambiguous and conflict with the approved nomenclature for several other genes. Therefore, there is a need to implement a rational and coherent nomenclature system for selenoprotein-encoding genes. Our solution is to use the root symbol SELENO followed by a letter. This nomenclature applies to SELENOF (selenoprotein F, the 15-kDa selenoprotein, SEP15), SELENOH (selenoprotein H, SELH, C11orf31), SELENOI (selenoprotein I, SELI, EPT1), SELENOK (selenoprotein K, SELK), SELENOM (selenoprotein M, SELM), SELENON (selenoprotein N, SEPN1, SELN), SELENOO (selenoprotein O, SELO), SELENOP (selenoprotein P, SeP, SEPP1, SELP), SELENOS (selenoprotein S, SELS, SEPS1, VIMP), SELENOT (selenoprotein T, SELT), SELENOV (selenoprotein V, SELV), and SELENOW (selenoprotein W, SELW, SEPW1). This system, approved by the HUGO Gene Nomenclature Committee, also resolves conflicting, missing, and ambiguous designations for selenoprotein genes and is applicable to selenoproteins across vertebrates.

Autor

Regina, B. F.
Gladyshev, V.N.
Arnér, E.S.
Berry, M.J.
Bruford, E.A.
Burk, R.F.
Carlson, B.A.
Castellano, S.
Chavatte, L
Conrad, M.
Copeland, P.R.
Diamond, A.M.
Driscoll, D.M.
Ferreiro, A.
Flohé, L.
Green, F.R.
Guigó, R.
Handy, D.E
Hatfield, D.L.
Hesketh, J.
Hoffmann, P.R.
Holmgren, A.
Hondal, R.J.
Howard, M.T.
Huang, K.
Kim, H.-Y.
Kim, I.Y.
Köhrle, J.
Krol, A.
Kryukov, G.V.
Lee, B.J.
Lee, B.C.
Lei, X.G.
Liu, Q.
Lescure, A.
Lobanov, A.V.
Loscalzo, J.
Maiorino, M.
Mariotti, M.
Prabhu, K.S.
Rayman, M.P.
Rozovsky, S.
Schmidt, E.E.
Schomburg, L.
Schweizer, U.
Simonovic, M.
Sunde, R.A.
Tsuji, P.A.
Tweedie, S.
Ursini, F.F.
Whanger, P.D.
Zhang, Y.

Fuente

Journal of Biological Chemistry v. 291, no. 46, 2016. -- p. 24036-24040

Editor

American Society for Biochemistry and Molecular Biology

Fecha

2016

Derechos

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Formato

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Idioma

Inglés

Tipo

Artículo

Identificador

DOI: 10.1074/jbc.M116.756155

Document Item Type Metadata

Original Format

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Fecha de agregación
June 22, 2017
Colección
Bibliografía Nacional Química
Tipo de Elemento
Document
Etiquetas
, ,
Citación
Regina, B. F., “Selenoprotein gene nomenclature,” RIQUIM - Repositorio Institucional de la Facultad de Química - UdelaR, accessed May 31, 2020, http://riquim.fq.edu.uy/items/show/4622.
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