Identification of universal diagnostic peptide candidates for neglected tropical diseases caused by cestodes through the integration of multi-genome-wide analyses and immunoinformatic predictions

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Título

Identification of universal diagnostic peptide candidates for neglected tropical diseases caused by cestodes through the integration of multi-genome-wide analyses and immunoinformatic predictions

Tema

PEPTIDOS
ENFERMEDADES TROPICALES
GENOMA
CESTODOS
BIBLIOGRAFIA NACIONAL QUIMICA
2017

Abstract

Neglected tropical diseases caused by helminth infections currently affect millions of people worldwide. Among them, there are three tapeworm species of outstanding importance: Echinococcus granulosus, E. multilocularis, and Taenia solium, which are responsible for cystic echinococcosis, alveolar echinococcosis, and cysticercosis, respectively. Despite several attempts, there is still a need for an effective and low-cost serological diagnostic test that can be used in endemic countries. In the present work, we described an innovative bioinformatic workflow for a rational prediction of putative peptide candidates for one-step serological diagnosis of any of these infections. First, we predicted the theoretical secretome shared by the three tapeworms starting from their full reported proteomes. Then, through immunoinformatics, we identified proteins within the shared secretome displaying high antigenicity scores and bearing T cell epitopes able to bind most human MHC-II alleles. Secondly, in such proteins, we identified linear B cell epitopes without post-translational modifications, and mapped them on 3D modelled structures to visualize their antibody accessibilities. As a result, we finally suggested two antigenic peptides shared between the secretomes of the three parasite species, which could be further tested for their immunodiagnostic potential.

Autor

Miles, Sebastián
Navatta, Marco.
Mourglia Ettlin, Gustavo Daniel.

Fuente

Infection, Genetics and Evolution  v. 54, 2017. -- p. 338-346

Editor

Elsevier

Fecha

2017

Derechos

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Formato

PDF

Idioma

Inglés

Tipo

Artículo

Identificador

DOI: 10.1016/j.meegid.2017.07.020

Document Item Type Metadata

Original Format

PDF
Fecha de agregación
March 8, 2018
Colección
Bibliografía Nacional Química
Tipo de Elemento
Document
Etiquetas
, , ,
Citación
Miles, Sebastián, “Identification of universal diagnostic peptide candidates for neglected tropical diseases caused by cestodes through the integration of multi-genome-wide analyses and immunoinformatic predictions,” RIQUIM - Repositorio Institucional de la Facultad de Química - UdelaR, accessed September 23, 2018, http://riquim.fq.edu.uy/items/show/4878.
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