Antimicrobial and structural insights of a new snakin-like peptide isolated from Peltophorum dubium (Fabaceae)

Dublin Core

Título

Antimicrobial and structural insights of a new snakin-like peptide isolated from Peltophorum dubium (Fabaceae)

Tema

PEPTIDOS
ESCHERICHIA COLI
ANALISIS ANTIMICROMIBIANO
BIBLIOGRAFIA NACIONAL QUIMICA
2018

Abstract

Snakins are antimicrobial peptides (AMPs) found, so far, exclusively in plants, and known to be important in the defense against a wide range of pathogens. Like other plant AMPs, they contain several positively charged amino acids, and an even number of cysteine residues forming disulfide bridges which are considered important for their usual function. Despite its importance, studies on snakin tertiary structure and mode of action are still scarce. In this study, a new snakin-like gene was isolated from the native plant Peltophorum dubium, and its expression was verified in seedlings and adult leaves. The deduced peptide (PdSN1) shows 84% sequence identity with potato snakin-1 mature peptide, with the 12 cysteines characteristic from this peptide family at the GASA domain. The mature PdSN1 coding sequence was successfully expressed in Escherichia coli. The purified recombinant peptide inhibits the growth of important plant and human pathogens, like the economically relevant potato pathogen Streptomyces scabies and the opportunistic fungi Candida albicans and Aspergillus niger. Finally, homology and ab initio modeling techniques coupled to extensive molecular dynamics simulations were used to gain insight on the 3D structure of PdSN1, which exhibited a helix–turn–helix motif conserved in both native and recombinant peptides. We found this motif to be strongly coded in the sequence of PdSN1, as it is stable under different patterns of disulfide bonds connectivity, and even when the 12 cysteines are considered in their reduced form, explaining the previous experimental evidences.

Autor

Rodríguez Decuadro, Susana Beatriz.
Barraco Vega, Mariano
Dans, Pablo D.
Pandolfi, Valesca
Benko Issepon, Ana María

Fuente

Amino Acids v.50, 2018. -- p. 1245-1259

Editor

Springer

Fecha

2018

Derechos

Información sobre Derechos de Autor

(Por favor lea este aviso antes de abrir los documentos u objetos)

La legislación uruguaya protege el derecho de autor sobre toda creación literaria, científica o artística, tanto en lo que tiene que ver con sus derechos morales, como en lo referente a los derechos patrimoniales con sujeción a lo establecido por el derecho común y las siguientes leyes (LEY 9.739 DE 17 DE DICIEMBRE DE 1937 SOBRE PROPIEDAD LITERARIA Y ARTISTICA CON LAS MODIFICACIONES INTRODUCIDAS POR LA LEY DE DERECHO DE AUTOR Y DERECHOS CONEXOS No. 17.616 DE 10 DE ENERO DE 2003, LEY 17.805 DE 26 DE AGOSTO DE 2004, LEY 18.046 DE 24 DE OCTUBRE DE 2006)

ADVERTENCIA - La consulta de este documento queda condicionada a la aceptación de las siguientes condiciones de uso: Este documento es únicamente para usos privados enmarcados en actividades de investigación y docencia. No se autoriza su reproducción con fines de lucro. Esta reserva de derechos afecta tanto los datos del documento como a sus contenidos. En la utilización o cita de partes debe indicarse el nombre de la persona autora.

Formato

PDF

Idioma

Inglés

Tipo

Artículo

Identificador

DOI: 10.1007/s00726-018-2598-3

Document Item Type Metadata

Original Format

PDF
Fecha de agregación
November 7, 2018
Colección
Bibliografía Nacional Química
Tipo de Elemento
Document
Etiquetas
, ,
Citación
Rodríguez Decuadro, Susana Beatriz., “Antimicrobial and structural insights of a new snakin-like peptide isolated from Peltophorum dubium (Fabaceae),” RIQUIM - Repositorio Institucional de la Facultad de Química - UdelaR, accessed November 14, 2018, http://riquim.fq.edu.uy/items/show/5345.
Archivos