Identification of active denitrifiers by DNA-stable isotope probing and amplicon sequencing reveals Betaproteobacteria as responsible for attenuation of nitrate contamination in a low impacted aquifer

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Título

Identification of active denitrifiers by DNA-stable isotope probing and amplicon sequencing reveals Betaproteobacteria as responsible for attenuation of nitrate contamination in a low impacted aquifer

Tema

BACTERIAS
AGUAS SUBTERRANEAS
BETAPROTEOBACTERIAS
DESNITRIFICACION
BIBLIOGRAFIA NACIONAL QUIMICA
2018

Abstract

Groundwater reservoirs constitute important freshwater resources. However, these ecosystems are highly vulnerable to contamination and have to rely on the resident microbiota to attenuate the impact of this contamination. Nitrate is one of the main contaminants found in groundwater, and denitrification is the main process that removes the compound. In this study, the response to nutrient load on indigenous microbial communities in groundwater from a low impacted aquifer in Uruguay was evaluated. Denitrification rates were measured in groundwater samples from three different sites with nitrate, acetate and pyrite amendments. Results showed that denitrification is feasible under in situ nitrate and electron donor concentrations, although the lack of readily available organic energy source would limit the attenuation of higher nitrate concentrations. DNA-stable isotope probing, combined with amplicon sequencing of 16S rRNA, nirS and nirK genes, was used to identify the active denitrifiers. Members of the phylum Betaproteobacteria were the dominant denitrifiers in two of three sites, with different families being observed; members of the genus Vogesella (Neisseriaceae) were key denitrifiers at one site, while the genera Dechloromonas (Rhodocyclaceae) and Comamonas (Comamonadaceae) were the main denitrifiers detected at the other sites.

Autor

Bellini, María Inés
Kumaresan, Deepak
Murell, J. Colin

Fuente

FEMS Microbiology Ecology v. 94, no.2, 2018. -- p. fix181/1-fix181/13

Editor

Oxford University Press

Fecha

2018

Derechos

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Formato

PDF

Idioma

Inglés

Tipo

Artículo

Identificador

DOI: 10.1093/femsec/fix181

Document Item Type Metadata

Original Format

PDF
Fecha de agregación
March 25, 2019
Colección
Bibliografía Nacional Química
Tipo de Elemento
Document
Etiquetas
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Citación
Bellini, María Inés, “Identification of active denitrifiers by DNA-stable isotope probing and amplicon sequencing reveals Betaproteobacteria as responsible for attenuation of nitrate contamination in a low impacted aquifer,” RIQUIM - Repositorio Institucional de la Facultad de Química - UdelaR, accessed March 2, 2021, http://riquim.fq.edu.uy/items/show/5654.
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