Elucidation of the O-antigen structure of Escherichia coli O63

Dublin Core

Título

Elucidation of the O-antigen structure of Escherichia coli O63

Tema

ENZIMAS
ESCHERICHIA COLI
ANTIGENOS
BIBLIOGRAFIA NACIONAL QUIMICA
2018

Abstract

The structure of the O-antigen polysaccharide (PS) from the Shiga-toxin producing Escherichia coli O63 has been elucidated using a combination of bioinformatics, component analyses and NMR spectroscopy. The O-antigen is comprised of tetrasaccharide repeating units with the following structure: →2)-β-d-Quip3N(d-allo-ThrAc)-(1→2)-β-d-Ribf-(1→4)-β-d-Galp-(1→3)-α-d-GlcpNAc-(1→ in which the N-acetylated d-allo-threonine is amide-linked to position 3 of the 3-amino-3-deoxy-d-Quip sugar residue. The presence of a predicted flippase and polymerase encoded in the O63 gene cluster is consistent with the Wzx/Wzy biosynthetic pathway and consequently the biological repeating unit has likely an N-acetyl-d-glucosamine residue at its reducing end. A bioinformatics approach based on predictive glycosyltransferase function present in ECODAB (E. coli O-antigen database) suggested the structural element β-d-Galp-(1→3)-d-GlcpNAc in the O-antigen. Notably, multiple gene sequence alignment of fdtA and qdtA from E. coli to that in E. coli O63 resulted in discrimination between the two, confirmation of the latter in E. coli O63, and consequently, together with qdtB, biosynthesis of dTDP-d-Quip3N. The E. coli O63 O-antigen polysaccharide differs in two aspects from that of E. coli O114 where the latter carries instead an l-serine residue, and the glycosidic linkage positions to and from the Quip3N residue are both changed. The structural characterization of the O63 antigen repeat supports the predicted functional assignment of the O-antigen cluster genes.

Autor

Ståhle, J.
Fontana, C.
Weintraub, A.
Widmalm, G.

Fuente

Glycobiology v.29, no.2, 2018. --p. 179-187

Editor

Oxford University Press

Fecha

2018

Derechos

Información sobre Derechos de Autor

(Por favor lea este aviso antes de abrir los documentos u objetos)

La legislación uruguaya protege el derecho de autor sobre toda creación literaria, científica o artística, tanto en lo que tiene que ver con sus derechos morales, como en lo referente a los derechos patrimoniales con sujeción a lo establecido por el derecho común y las siguientes leyes (LEY 9.739 DE 17 DE DICIEMBRE DE 1937 SOBRE PROPIEDAD LITERARIA Y ARTISTICA CON LAS MODIFICACIONES INTRODUCIDAS POR LA LEY DE DERECHO DE AUTOR Y DERECHOS CONEXOS No. 17.616 DE 10 DE ENERO DE 2003, LEY 17.805 DE 26 DE AGOSTO DE 2004, LEY 18.046 DE 24 DE OCTUBRE DE 2006)

ADVERTENCIA - La consulta de este documento queda condicionada a la aceptación de las siguientes condiciones de uso: Este documento es únicamente para usos privados enmarcados en actividades de investigación y docencia. No se autoriza su reproducción con fines de lucro. Esta reserva de derechos afecta tanto los datos del documento como a sus contenidos. En la utilización o cita de partes debe indicarse el nombre de la persona autora.

Formato

PDF

Idioma

Inglés

Tipo

Artículo

Identificador

DOI:10.1093/glycob/cwy098

Document Item Type Metadata

Original Format

PDF
Fecha de agregación
April 4, 2019
Colección
Bibliografía Nacional Química
Tipo de Elemento
Document
Etiquetas
, ,
Citación
Ståhle, J., “Elucidation of the O-antigen structure of Escherichia coli O63,” RIQUIM - Repositorio Institucional de la Facultad de Química - UdelaR, accessed May 24, 2019, http://riquim.fq.edu.uy/items/show/5697.
Archivos