Multiple Introductions of Tomato Pathogen Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis into Iran as Revealed by a Global-Scale Phylogeographic Analysis

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Título

Multiple Introductions of Tomato Pathogen Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis into Iran as Revealed by a Global-Scale Phylogeographic Analysis

Tema

TOMATE
AGENTES PATOGENOS
IRAN
CULTIVOS SOLANACEOS
CLAVIBACTER MICHIGANENSIS
BIBLIOGRAFIA NACIONAL QUIMICA
2019

Abstract

Tomato bacterial canker caused by Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis is one of the most important seed-borne tomato diseases around the globe. The disease was initially reported in 1993 in Iran, and it became a rising threat for the multibillion dollar tomato industry of the country during the last decade. In this study, using phylogeographic analyses, we determined genetic diversity and geographic distribution of C. michiganensis subsp. michiganensis in Iran. Our field surveys showed that the pathogen is expanding into the southern and eastern areas of the country. Furthermore, multilocus sequence analysis and typing (MLSA/MLST) using the sequences of five housekeeping genes (atpD, gyrB, ppk, recA, and rpoB) revealed that 37 C. michiganensis subsp. michiganensis strains isolated in Iran had high genetic diversity and placed in 15 sequence types (STs), while all the available 184 worldwide C. michiganensis subsp. michiganensis sequences were placed in 43 STs. MLSA divided the worldwide C. michiganensis subsp. michiganensis strains into two phylogroups (I and II). Among the 37 strains isolated in Iran, 30 strains clustered in phylogroup I, while 7 strains clustered in phylogroup II. Phylogeographic data inferred from the allelic profile of the five housekeeping genes suggested multiple introductions of C. michiganensis subsp. michiganensis inoculum into Iran, while the geographic origin of the Iranian C. michiganensis subsp. michiganensis strains remains undetermined. Further analyses using higher numbers of strains are warranted to decipher the evolutionary history of C. michiganensis subsp. michiganensis in Iran. Additionally, stricter seed/transplant inspections are recommended to reduce the risk of pathogen expansion to areas with no history of the disease

Autor

Ansari, Maryam
Taghavi, S. Mohsen
Hamzehzarghani, Habiballah
Valenzuela, Myryam
Siri, María Inés
Osdaghi, Ebrahim

Fuente

Applied and Environmental Microbiology v. 85, no. 24, 2019. -- e02098-19

Editor

American Society for Microbiology

Fecha

2019

Derechos

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Formato

PDF

Idioma

Inglés

Tipo

Artículo

Identificador

DOI: 10.1128/AEM.02098-19

Document Item Type Metadata

Original Format

PDF
Fecha de agregación
January 21, 2020
Colección
Bibliografía Nacional Química
Tipo de Elemento
Document
Etiquetas
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Citación
Ansari, Maryam, “Multiple Introductions of Tomato Pathogen Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis into Iran as Revealed by a Global-Scale Phylogeographic Analysis,” RIQUIM - Repositorio Institucional de la Facultad de Química - UdelaR, accessed April 6, 2020, http://riquim.fq.edu.uy/items/show/5977.
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