In silico characterization of cytisinoids docked into an acetylcholine binding protein

Dublin Core

Título

In silico characterization of cytisinoids docked into an acetylcholine binding protein

Tema

RECEPTORES NICOTÍNICOS
NEUROTRANSMISORES
BIBLIOGRAFÍA NACIONAL QUÍMICA
2010

Abstract

Homology models of nicotinic acetylcholine receptors (nAChRs) suggest that subtype specificity is due to non-conserved residues in the complementary subunit of the ligand-binding pocket. Cytisine and its derivatives generally show a strong preference for heteromeric a4b2* nAChRs over the homomeric a7 subtype, and the structural modifications studied do not cause large changes in their nAChR subtype selectivity. In the present work we docked cytisine, N-methylcytisine, and several pyridone ring-substituted cytisinoids into the crystallographic structure of the Lymnaea stagnalis acetylcholine binding protein (AChBP) co-crystallized with nicotine (1UW6). The graphical analysis of the best poses showed that cytisinoids have weak interactions with the side chains of the non-conserved amino acids in the complementary subunit justifying the use of PDB 1UWB as a surrogate for nAChR. Furthermore, we found a high correlation (R2 = 0.96) between the experimental pIC50 values at a4b2* nAChR and docking energy (S) of the best cytisinoid poses within the AChBP. Due to the quality of the correlation we suggest that this equation might be used as a predictive model to propose new cytisine-derived nAChRs ligands. Our docking results also suggest that further structural modifications of these cytisinoids will not greatly alter their a4b2*/a7 selectivity.

Autor

Abin-Carriquiry, Juan Andrés
Bruce K. Cassels
Susan Wonnacott
Dajas, Federico

Fuente

Biorganic and Medicinal Chemistry v. 20, no. 12, 2010. -- 3683-3687

Editor

Elsevier

Fecha

2010

Derechos

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Formato

PDF

Idioma

Inglés

Tipo

Artículo

Identificador

doi:10.1016/j.bmcl.2010.04.092
Fecha de agregación
November 3, 2014
Colección
Bibliografía Nacional Química
Tipo de Elemento
Document
Etiquetas
,
Citación
Abin-Carriquiry, Juan Andrés, “In silico characterization of cytisinoids docked into an acetylcholine binding protein,” RIQUIM - Repositorio Institucional de la Facultad de Química - UdelaR, accessed April 19, 2024, https://riquim.fq.edu.uy/items/show/1996.
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