Active methylotrophs in the sediments of Lonar Lake, a saline and alkaline ecosystem formed by meteor impact

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Título

Active methylotrophs in the sediments of Lonar Lake, a saline and alkaline ecosystem formed by meteor impact

Tema

ECOSISTEMAS
MICROBIOLOGIA
SEDIMENTOLOGIA
BIBLIOGRAFIA NACIONAL QUIMICA
2010

Abstract

Lonar Lake is a unique saline and alkaline ecosystem formed by meteor impact in the Deccan basalts in India around 52,000 years ago. To investigate the role of methylotrophy in the cycling of carbon in this unusual environment, stable-isotope probing (SIP) was carried out using the one-carbon compounds methane, methanol and methylamine. Denaturing gradient gel electrophoresis fingerprinting analyses performed with heavy (13)C-labelled DNA retrieved from sediment microcosms confirmed the enrichment and labelling of active methylotrophic communities. Clone libraries were constructed using PCR primers targeting 16S rRNA genes and functional genes. Methylomicrobium, Methylophaga and Bacillus spp. were identified as the predominant active methylotrophs in methane, methanol and methylamine SIP microcosms, respectively. Absence of mauA gene amplification in the methylamine SIP heavy fraction also indicated that methylamine metabolism in Lonar Lake sediments may not be mediated by the methylamine dehydrogenase enzyme pathway. Many gene sequences retrieved in this study were not affiliated with extant methanotrophs or methylotrophs. These sequences may represent hitherto uncharacterized novel methylotrophs or heterotrophic organisms that may have been cross-feeding on methylotrophic metabolites or biomass. This study represents an essential first step towards understanding the relevance of methylotrophy in the soda lake sediments of an unusual impact crater structure

Autor

Antony, C. P.
Kumaresan, D.
Ferrando, L
Boden, R.
Moussard, H.
Shouche, Y. S.
Murrell, J. C.

Fuente

ISME Journal v. 4, no. 11, 2010. -- p. 1470-1480

Editor

International Society for Microbial Ecology

Fecha

2010

Derechos

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Formato

PDF

Idioma

Inglés

Tipo

Artículo

Identificador

ISSN: 1751-7362

Document Item Type Metadata

Original Format

PDF
Fecha de agregación
November 25, 2014
Colección
Bibliografía Nacional Química
Tipo de Elemento
Document
Etiquetas
, ,
Citación
Antony, C. P., “Active methylotrophs in the sediments of Lonar Lake, a saline and alkaline ecosystem formed by meteor impact,” RIQUIM - Repositorio Institucional de la Facultad de Química - UdelaR, accessed October 27, 2020, http://riquim.fq.edu.uy/items/show/2061.
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