Phage-host interactions in Streptococcus thermophilus : Genome analysis of phages isolated in Uruguay and ectopic spacer acquisition in CRISPR array

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Título

Phage-host interactions in Streptococcus thermophilus : Genome analysis of phages isolated in Uruguay and ectopic spacer acquisition in CRISPR array

Tema

STREPTOCOCCUS THERMOPHILUS
GENOMA
URUGUAY
BIBLIOGRAFIA NACIONAL QUIMICA
2017

Abstract

Three cos-type virulent Streptococcus thermophilus phages were isolated from failed mozzarella production in Uruguay. Genome analyses showed that these phages are similar to those isolated elsewhere around the world. The CRISPR1 and CRISPR3 arrays of the three S. thermophilus host strains from Uruguay were also characterized and similarities were noted with previously described model strains SMQ-301, LMD-9 and DGCC7710. Spontaneous bacteriophage-insensitive S. thermophilus mutants (BIMs) were obtained after challenging the phage-sensitive wild-type strain Uy02 with the phage 128 and their CRISPR content was analyzed. Analysis of 23 BIMs indicated that all of them had acquired at least one new spacer in their CRISPR1 array. While 14 BIMs had acquired spacer at the 5'-end of the array, 9 other BIMs acquired a spacer within the array. Comparison of the leader sequence in strains Uy02 and DGCC7710 showed a nucleotide deletion at position -1 in Uy02, which may be responsible for the observed ectopic spacer acquisition. Analysis of the spacer sequences upstream the newly acquired ectopic spacer indicated presence of a conserved adenine residue at position -2. This study indicates that natural strains of S. thermophilus can also acquire spacers within a CRISPR array.

Autor

Achigar Rivero, Rodrigo.
Magadán, Alfonso H.
Tremblay, Denise M.
Moineau, Sylvain

Fuente

Scientific Reports v. 7, 2017. -- p. 1-9.-- e43438

Editor

Springer Nature

Fecha

2017

Derechos

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Formato

pdf

Idioma

Inglés

Tipo

Artículo

Identificador

DOI: 10.1038/srep43438

Document Item Type Metadata

Original Format

PDF
Fecha de agregación
January 2, 2018
Colección
Bibliografía Nacional Química
Tipo de Elemento
Document
Etiquetas
,
Citación
Achigar Rivero, Rodrigo., “Phage-host interactions in Streptococcus thermophilus : Genome analysis of phages isolated in Uruguay and ectopic spacer acquisition in CRISPR array,” RIQUIM - Repositorio Institucional de la Facultad de Química - UdelaR, accessed April 21, 2018, http://riquim.fq.edu.uy/items/show/4810.
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