The Distribution of Onion Virulence Gene Clusters Among Pantoea spp.

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Título

The Distribution of Onion Virulence Gene Clusters Among Pantoea spp.

Tema

CEBOLLAS
BACTERIAS
VIRUS
ENFERMEDADES DE LAS PLANTAS
BIBLIOGRAFIA NACIONAL QUIMICA
2021

Abstract

Pantoea ananatis is a gram-negative bacterium and the primary causal agent of center rot of onions in Georgia. Previous genomic studies identified two virulence gene clusters, HiVir and alt, associated with center rot. The HiVir gene cluster is required to induce necrosis on onion tissues via synthesis of pantaphos, (2-hydroxy[phosphonomethyl) maleate), a phosphonate phytotoxin. The alt gene cluster aids in tolerance
to thiosulfinates generated during onion tissue damage. Whole genome sequencing of other Pantoea species suggests that these gene clusters are present outside of P. ananatis. To assess the distribution of these gene clusters, two PCR primer sets were designed to detect the presence of HiVir and alt. Two hundred fifty-two strains of Pantoea spp. were phenotyped using the red onion scale necrosis (RSN) assay and were genotyped using PCR for the presence of these virulence genes. A diverse panel of strains from three distinct culture collections comprised of 24 Pantoea species, 41 isolation sources, and 23 countries, collected from 1946–2019, was tested. There is a
significant association between the alt PCR assay and Pantoea strains recovered from symptomatic onion (P < 0.001). There is also a significant association of a positive HiVir PCR and RSN assay among P. ananatis strains but not among Pantoea spp.,
congeners. This may indicate a divergent HiVir cluster or different pathogenicity and virulence mechanisms. Last, we describe natural alt positive [RSN C /HiVir C /alt C ]
P. ananatis strains, which cause extensive bulb necrosis in a neck-to-bulb infection assay compared to alt negative [RSN C /HiVir C /alt

Autor

Stice, Shaun P.
Shin, Gi Yoon
De Armas, Stefanie
Koirala, Santosh
Galván, Guillermo A.
Severns, Paul M.
Coutinho, Teresa
Dutta, Bhabesh
Kvitko, Brian H.

Fuente

Frontiers in Plant Science v. 12. 2021. -- e643787

Editor

Frontiers

Date Available

2021

Derechos

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Formato

PDF

Idioma

Inglés

Tipo

Artículo

Document Item Type Metadata

Original Format

PDF

 

Fecha de agregación
September 1, 2021
Colección
Bibliografía Nacional Química
Tipo de Elemento
Document
Etiquetas
, , ,
Citación
Stice, Shaun P., “The Distribution of Onion Virulence Gene Clusters Among Pantoea spp.,” RIQUIM - Repositorio Institucional de la Facultad de Química - UdelaR, accessed September 20, 2021, http://riquim.fq.edu.uy/items/show/6335.
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