Methylogaea oryzae gen. nov., sp. nov., a novel mesophilic methanotroph from a rice paddy field in Uruguay

ARROZ

BACTERIAS

ANAEROBIOSIS

BIBLIOGRAFIA NACIONAL QUIMICA

2011

ENERGIA METABOLICA

A novel methanotroph, strain E10T, was isolated from a rice paddy field in Uruguay. Strain E10T grows on methane or methanol as its sole carbon and energy source. It is a Gram-negative, non-motile, non-pigmented, slightly curved rod showing type I intracytoplasmic membranes arranged in stacks. It is neutrophilic and mesophilic (optimum growth at 30-35 °C and with no growth above 37°C). The strain only possesses a particulate methane monooxygenase (pmoA). Phylogenetic analysis based on the 16S rRNA gene sequence indicated that it is most closely related to the moderately thermophilic strains Methylocaldum szegediense OR2T (91.6 % similarity) and Methylococcus capsulatus Bath (91.5 % similarity). Comparative sequence analysis of the pmoA genes also confirmed that strain E10T forms a new lineage among the genera Methylocaldum and Methylococcus (89 and 84% derived amino acid sequence identity to Methylococcus capsulatus Bath and Methylocaldum gracile VKM-14LT, respectively). The DNA G+C content is 63.1 mol% and the major cellular fatty acid is 16:0 (62.05%). Thus, it is proposed that strain E10T (= JCM 16910T=DSM 23452T) represents the type strain of a novel species within a new genus, Methylogaea oryzae gen. nov., sp. nov.

International Journal of Systematic Evolutionary Microbiology |g v. 61, no. pt 11, 2011. -- p.2568-2572

HighWire Press

2011

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Artículo

doi: 10.1099/ijs.0.028274-0

Uruguay