Activity and diversity of methanotrophs in the soil-waterr interface and rhizospheric soil from a flooded temperate rice field

Dublin Core

Título

Activity and diversity of methanotrophs in the soil-waterr interface and rhizospheric soil from a flooded temperate rice field

Tema

BACTERIA
ARROZ
AGUA DE SUELO
ARROZ-CAMPO

Abstract

Aims: To combine molecular and cultivation techniques to characterize the methanotrophic community in the soil–water interface (SWI) and rhizospheric soil from flooded rice fields in Uruguay, a temperate region in South America. Methods and Results: A novel type I, related to the genus Methylococcus, and three type II methanotrophs were isolated from the highest positive dilution steps from the most probable number (MPN) counts. Potential methane oxidation activities measured in slurried samples were higher in the rhizospheric soil compared to the SWI and were stimulated by N-fertilization. PmoA (particulate methane monooxygenase) clone libraries were constructed for both rice microsites. SWI clones clustered in six groups related to cultivated and uncultivated members from different ecosystems of the genera Methylobacter, Methylomonas, Methylococcus and a novel type I sublineage while cultivation and T-RFLP (terminal restriction fragment length polymorphism) analysis confirmed the presence of type II methanotrophs. Conclusions: Cultivation techniques, cloning analysis and T-RFLP fingerprinting of the pmoA gene revealed a diverse methanotrophic community in the rice rhizospheric soil and SWI. Significance and Impact of the Study: This study reports, for the first time, the analysis of the methanotrophic diversity in rice SWI and this diversity may be exploited in reducing methane emissions.

Autor

Ferrando, Lucía

Editor

Willey

Fecha

2009

Derechos

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Formato

PDF

Idioma

Ingles

Tipo

Artículo

Identificador

DOI:10.1111/j.1365-2672.2008.04004.x
Fecha de agregación
March 10, 2014
Colección
Bibliografía Nacional Química
Tipo de Elemento
Document
Etiquetas
, ,
Citación
Ferrando, Lucía, “Activity and diversity of methanotrophs in the soil-waterr interface and rhizospheric soil from a flooded temperate rice field,” RIQUIM - Repositorio Institucional de la Facultad de Química - UdelaR, accessed April 25, 2024, https://riquim.fq.edu.uy/items/show/1296.
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