Ligand Selectivity between the ADP-Ribosylating Toxins : An Inverse- Docking Study for Multitarget Drug Discovery

ENZIMAS

TOXINAS RIBOSILANTES

ANTIINFECCIOSOS

BIBLIOGRAFIA NACIONAL QUIMICA

2017

Bacterial adenosine 5’-diphosphate-ribosylating toxins are encoded by several human pathogens, such as Pseudomonas aeruginosa (exotoxin A (ETA)), Corynebacterium diphtheriae (diphtheria toxin (DT)), and Vibrio cholerae (cholix toxin (CT)). The toxins modify eukaryotic elongation factor 2, an essential human enzyme in protein synthesis, thereby causing cell death. Targeting external virulence factors, such as the above toxins, is a promising alternative for developing new antibiotics, while at the same time avoiding drug resistance. This study aims to establish a reliable computational methodology to find a “silver bullet” able to target all three toxins. Herein, we have undertaken a detailed analysis of the active sites of ETA, DT, and CT, followed by the determination of the most appropriate selection of the size of the docking sphere. Thereafter, we tested two different approaches for normalizing the docking scores and used these to verify the best target (toxin) for each ligand. The results indicate that the methodology is suitable for identifying selective as well as multitoxin inhibitors, further validating the robustness of inverse docking for target-fishing experiments.

ACS Omega v. 2, 2017. -- p. 1710-1719

ACS

2017

Información sobre Derechos de Autor

(Por favor lea este aviso antes de abrir los documentos u objetos)

La legislación uruguaya protege el derecho de autor sobre toda creación literaria, científica o artística, tanto en lo que tiene que ver con sus derechos morales, como en lo referente a los derechos patrimoniales con sujeción a lo establecido por el derecho común y las siguientes leyes (LEY 9.739 DE 17 DE DICIEMBRE DE 1937 SOBRE PROPIEDAD LITERARIA Y ARTISTICA CON LAS MODIFICACIONES INTRODUCIDAS POR LA LEY DE DERECHO DE AUTOR Y DERECHOS CONEXOS No. 17.616 DE 10 DE ENERO DE 2003, LEY 17.805 DE 26 DE AGOSTO DE 2004, LEY 18.046 DE 24 DE OCTUBRE DE 2006)

ADVERTENCIA - La consulta de este documento queda condicionada a la aceptación de las siguientes condiciones de uso: Este documento es únicamente para usos privados enmarcados en actividades de investigación y docencia. No se autoriza su reproducción con fines de lucro. Esta reserva de derechos afecta tanto los datos del documento como a sus contenidos. En la utilización o cita de partes debe indicarse el nombre de la persona autora.

PDF

Inglés

Artículo

DOI: 10.1021/acsomega.7b00010

PDF