Base-pair conformational switch modulates miR-34a targeting of Sirt1 mRNA

Dublin Core

Título

Base-pair conformational switch modulates miR-34a targeting of Sirt1 mRNA

Tema

BIOQUIMICA
MOLECULAR DE ARN
BIBLIOGRAFIA NACIONAL QUIMICA
2020

Abstract

MicroRNAs (miRNAs) regulate the levels of translation of messenger RNAs (mRNAs). At present, the major parameter that can explain the selection of the target mRNA and the efficiency of translation repression is the base pairing between the ‘seed’ region of the miRNA and its counterpart mRNA1. Here we use R1ρ relaxation-dispersion nuclear magnetic resonance2 and molecular simulations3 to reveal a dynamic switch—based on the rearrangement of a single base pair in the miRNA–mRNA duplex—that elongates a weak five-base-pair seed to a complete seven-base-pair seed. This switch also causes coaxial stacking of the seed and supplementary helix fitting into human Argonaute 2 protein (Ago2), reminiscent of an active state in prokaryotic Ago4,5. Stabilizing this transient state leads to enhanced repression of the target mRNA in cells, revealing the importance of this miRNA–mRNA structure. Our observations tie together previous findings regarding the stepwise miRNA targeting process from an initial ‘screening’ state to an ‘active’ state, and unveil the role of the RNA duplex beyond the seed in Ago2.

Autor

Baronti, Lorenzo
Guzzetti, Ileana
Ebrahimi, Parisa
Friebe Sandoz, Sarah
Schlagnitweit, Judith
Fromm, Bastlan
Silva, Luis
Fontana, Carolina
Chen, Alan A.
Petzold, Katja

Fuente

Nature 2020.-- p. 1-21

Editor

Springer Nature Limited

Fecha

2020

Derechos

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Formato

PDF

Idioma

Inglés

Tipo

Artículo

Identificador

DOI: 10.1038/s41586-020-2336-3

Document Item Type Metadata

Original Format

PDF
Fecha de agregación
July 1, 2020
Colección
Bibliografía Nacional Química
Tipo de Elemento
Document
Etiquetas
,
Citación
Baronti, Lorenzo, “Base-pair conformational switch modulates miR-34a targeting of Sirt1 mRNA,” RIQUIM - Repositorio Institucional de la Facultad de Química - UdelaR, accessed October 23, 2020, http://riquim.fq.edu.uy/items/show/6101.
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