Tandem repeat-tRNA (TRtRNA) PCR method for the molecular typing of non-Saccharomyces subspecies

Dublin Core

Título

Tandem repeat-tRNA (TRtRNA) PCR method for the molecular typing of non-Saccharomyces subspecies

Tema

VINOS
LEVADURAS
BIBLIOGRAFIA NACIONAL QUIMICA
2012

Abstract

There is a worldwide trend to understand the impact of non-Saccharomyces yeast species on the process of winemaking. Although the predominant species at the end of the fermentation is Saccharomyces cerevisiae, several non-Saccharomyces species present during the first days of the process can produce and/or release aromas that improve the bouquet and complexity of the final wine. Since no genomic sequences are available for the predominant non-Saccharomyces species selected from grapes or musts (Hanseniaspora uvarum, Hanseniaspora vineae, Hanseniaspora opuntiae, Metschnikowia pulcherrima, Candida zemplinina), a reproducible PCR method was devised to discriminate strains at the subspecies level. The method combines different oligonucleotides based on tandem repeats with a second oligonucleotide based on a conserved tRNA region, specific for ascomycetes. Tandem repeats are randomly dispersed in all eukaryotic genomes and tRNA genes are conserved and present in several copies in different chromosomes. As an example, the method was applied to discriminate native M. pulcherrima strains but it could be extended to differentiate strains from other non-Saccharomyces species. The biodiversity of species and strains found in the grape ecosystem is a potential source of new enzymes, fungicides and/or novel sustainable methods for biological control of phytopathogens.

Autor

Barquet, Marianne
Martín Valverde, Antonio
Medina, Karina
Perez, Gabriel
Gaggero de Munno, Carina

Fuente

Applied Microbiology and Biotechnology  v. 93, no. 2, 2012. -- p. 807-814

Editor

Springer

Fecha

2012

Derechos

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Formato

PDF

Idioma

Inglés

Tipo

Artículo

Identificador

ISSN 0175-7598
DOI 10.1007/s00253-011-3714-4

Cobertura

 

 

Document Item Type Metadata

Original Format

PDF
Fecha de agregación
August 1, 2012
Colección
Bibliografía Nacional Química
Tipo de Elemento
Document
Etiquetas
, ,
Citación
Barquet, Marianne, “Tandem repeat-tRNA (TRtRNA) PCR method for the molecular typing of non-Saccharomyces subspecies,” RIQUIM - Repositorio Institucional de la Facultad de Química - UdelaR, accessed July 23, 2018, http://riquim.fq.edu.uy/items/show/22.
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